一般治療對重癥患者應先給予對癥及支持療法，如增加營養、糾正貧血、利尿消腫等，待全身情況好轉后，再進行驅蟲治療。少數病例因一次大量感染，可出現寒戰、高熱、肝區疼痛及輕度黃疸，血轉氨酶升高，血象嗜酸性粒細胞顯著增高等急性華支睪吸蟲病癥狀。
1.病原治療
（1）吡喹酮是治療本病的首選藥物，具有療程短、療效高、毒性低、反應輕以及在體內吸收、代謝、排泄快等優點。連服2天。治療后3個月糞便蟲卵陰轉率達90%以上。少數病例在服用時出現頭暈、頭痛、乏力、惡心、腹痛、腹瀉等不良反應，24小時后可減輕或消失。一般治療量對肝、腎無明顯損害。個別患者可有期前收縮、心律失常等。
（2）阿苯達唑近年來臨床上應用阿苯達唑治療本病，效果滿意。分2次服，7天為一個療程。糞便蟲卵陰轉率幾乎為100%。
2.對癥治療
對重度感染并有較重營養不良或肝硬化者，應加強營養，糾正貧血，保護肝臟，以改善全身狀況，并及時進行驅蟲治療。并發膽囊炎、膽管炎者，除驅蟲外并加用抗菌藥物。對急性膽囊炎、膽石癥、膽總管梗阻時應予手術治療。合并病毒性肝炎時，除積極保護肝臟外，應在病情改善的基礎上盡早進行驅蟲治療。