2 ITC的應用 1)蛋白質-小分子和酶-抑制物相互作用; 2)蛋白質-糖類相互作用; 3)蛋白質-蛋白質相互作用:如Jacobson等用ITC研究了人細胞RNA聚合酶Ⅱ轉錄因子TFIID的最大亞單位TAFII250的組蛋白乙酰基轉移酶活性(Jacobson et al., 2000)。日本Kanagawa科學技術研究所的Tahirov等利用ITC、CD和UV研究了AML1/Runx-1小結構域識別的DNA結構及CBFβ控制的構象調整,闡明了CBFβ與CBFα間的相互作用模式及前者調控后者結合到DNA上的機制(Tahirov, et al., 2001)。 3)蛋白質-脂質相互作用; 4)脂質間以及脂質-小分子相互作用; 5)核酸-小分子相互作用; 6)蛋白質-核酸相互作用; 7)核酸-核酸相互作用; 8)抗體研究:美國Johns Hopkins大學生物系的生物量熱學中心是目前世界上從事生物量熱學最活躍和處于領先水平的實驗室,該中心的Freire小組(Murphy et al., 1993, 1995)應用高靈敏度ITC分別研究了血管緊縮素與其單克隆抗體和酸誘導去折疊細胞色素c與其單克隆抗體的結合,發現上述結合過程均為焓和熵同時驅動的反應,實驗結果表明,這些過程中溶劑釋放所導致的熵增過量補償了因結合而引起的構象熵的損失。 9)受體相互作用; 10)蛋白質折疊和穩定性:如美國的Wright小組應用ITC和核磁共振(NMR)等技術研究了核激素受體蛋白的一個結構域與甲狀腺素及類纖維素A受體相互作用的熱力學,發現雖然分開的結構域本身很凌亂,但是它們之間有高的親和力而且是焓驅動的,并以一種獨特的協同折疊的機制形成螺旋異二聚體。 11)酶分析:如Freire小組應用等溫滴定微量熱法(ITC)結合高靈敏度差示掃描量熱法(DSC)和分光光度法研究了酵母細胞色素C氧化酶催化氧化其生理底物—亞鐵細胞色素c的熱力學和動力學,并分析了原鹽效應對該酶活性的影響。我們應用等溫微量熱法研究了超氧化物歧化酶催化歧化超氧陰離子等反應體系,獲得了這些酶促反應的各種熱力學和動力學信息,探討了相關催化機理,同時用該法研究了博萊霉素催化切割DNA的反應,從熱力學和動力學的角度嚴格地證明了博萊霉素在催化機制上類似于DNA切割酶,但其催化效率低于DNA切割酶,并用等溫滴定微量熱法研究了不同濃度鹽酸胍存在時肌酸激酶催化ATP與肌酸間轉磷酸化反應的熱力學,從熱力學的觀點確定了該酶促反應為快速平衡的隨機順序反應,還建立了新的肌酸激酶和超氧化物歧化酶活力測定方法—微量熱測活法。 值得指出的是,ITC不僅被應用于研究蛋白質折疊/去折疊,而且被應用于核酸折疊,例如英國的Hammann等人利用ITC研究了鎂離子誘導錘頭狀核酶折疊的熱力學,發現鎂離子與天然序列核酶的結合是一個強烈的放熱反應,和鎂離子與錘頭狀核酶不同序列變異體的結合有很大的區別,這些工作對于核酸折疊的熱力學研究是良好的開端。
ITC 應用示例
1 ITC法測量結合/解離常數 Christian Herrmann等運用ITC研究了Ras與效應物和Cdc42與效應物的相互作用。 Ras是一種在信號轉導過程中起重要作用的蛋白質。可以向其下游的許多信號轉導途徑輸送細胞內調控信號。Ras在非激活態,與GDP結合,當GDP被GTP取代時被激活,與其效應物(Raf,RalGDS,3-磷脂酰肌醇激酶)呈現更緊密的結合。Cdc42是一種GTPase,也是信號轉導相關的蛋白。它參與細胞增殖調控和肌動蛋白細胞骨架的調控。Cdc42在參與細胞骨架調控的過程中,很重要的一步是與WASP蛋白的相互作用。Ras及其效應物(Raf,RalGDS)的結合方式都很類似,包括富含親水氨基酸側鏈的反平行?-折疊。Cdc42及其效應物(WASP)的結合區則富含疏水氨基酸,其復合物也比Ras/效應物復合物大得多。