PCR(Polymerase Chain Reaction )是一種在體外特異的擴增基因的技術。由Kary.Mullis發明,該技術大大推動了分子生物學的發展,被認為是分子生物學發展的里程碑。Kary.Mullis分享了1993年諾貝爾化學獎。
復習細胞內DNA復制條件和過程。
一、目的
1:學習PCR技術的基本原理
2:掌握從全血中制備DNA的方法‘
3:掌握應用PCR擴增Hbβ基因的基本操作
4:熟悉Hb基因結構
二、原理
1:PCR擴增的原理
聚合酶鏈反應—PCR是一種體外基因擴增技術,是在引物和四種脫氧核苷三磷酸存在下,利用DNA 聚合酶反復作用,使微量的特定片段得以大量擴增的反應過程。
PCR所需的條件:模板
引物:決定擴增產物的特異性
dNTPs
Taq聚合酶
Mg2+
PCR反應過程
每三步為一個循環,每循環一次,使模板DNA拷貝數增加1倍,理論上講,30個循環后,擴增產物為230拷貝
本實驗應用PCR技術擴增Hbβ基因上400bp片段
引物序列為 A:5′-AAG GAG ACC AAT AGA AAC TGG GC- 3′
B:5′-TCT CCC CTT CCT ATG ACA TGA AC- 3′
3:PCR 產物的鑒定
含溴乙錠的2%瓊脂糖凝膠電泳
DNA在pH8.0電泳緩沖液環境下帶負電荷,向陽極移動。DNA分子量大小及形狀不同,電泳速度不同。在分子形狀相同的條件下,分子量(bp數)越大,電泳速度越慢;分子量(bp數)越小,電泳速度越快;分子量(bp數)相同,電泳速度相同。所以PCR擴增產物可以根據分子量(bp數)的大小進行分離。bp數相同的DNA集中在同一位置上,與EB結合成復合物,在紫外燈激發下,發出桔紅色的熒光,而形成桔紅色的區帶,根據Maker判斷擴增產物的長度。
三、儀器與試劑
(一)主要儀器:PCR儀 潛水式電泳儀 微量移液器 臺式高速離心機
(二) 試劑:裂解液(Tris-HCl TritonX-100) 生理鹽水 雙蒸水
PCR反應液 液體石蠟 載樣緩沖液 電泳緩沖液
四、方法
(一)模板的制備
裂解細胞膜 1:用刻度離心管取全血 0.5ml,加裂解液至3ml,顛倒混勻,振蕩60~80次。3,000rpm離心10分鐘。
去血紅素 2:棄上清,加生理鹽水至 3ml,振蕩直至沉淀成線狀,3,000rpm離心10分鐘。
3:重復步驟2一次
破壞細胞核膜 4:棄上清,離心管倒置在濾紙上控干,加ddH2O 50μl,用槍頭攪動沉淀,直至沉淀完全溶解。
去除蛋白質 5:全部轉移至1.5ml 離心 管,沸水鍋中煮沸10分鐘,12,000rpm離心5分鐘,上清液即含有模板DNA。
(二)PCR擴增
反應體系:總體積:25 μl
模板液 5.0μl
緩沖液(含 Mg2+) 2.0μl
dNTPs(2.5mM) 1.6μl
引物(10μm) 各0.8μl
Taq DNA聚合酶 (2.5U/ml) 0.8μl
ddH2O 14.0μl
循環參數:預變性94℃ 2分鐘
變性94℃ 30秒
退火55℃ 30秒
延伸 72℃ 45秒
最后延伸72℃ 10分鐘 共35個循環。
(三)擴增產物的鑒定:
1:制膠 將凝膠托架兩端封閉并水平放置在工作臺上,放上梳子,用1 ×TBE緩沖溶液配制2﹪瓊脂糖凝膠液,加熱溶解.注到托架上,待凝固后撤去兩端封閉插片.
2: 加樣 將托架放入電泳槽中,加入1×TBE緩沖溶液使之沒過膠面2㎜,拔出梳子,向PCR產物中加入載樣緩沖液,混合.將15μl混合物加入凝膠樣品孔中.載樣緩沖液中有蔗糖和溴酚蘭,可以增加樣品比重,同時有顏色指示劑的作用。
3:電泳 加樣端接負極,蓋上電泳槽,接通電源,以100V電壓電泳25分鐘.
4:觀察結果 在紫外燈下觀察電泳結果.與maker400bp相對應的區帶為Hbβ基因400bp片段.
五、注意事項
1:操作的整個過程中避免污染,因為PCR可以將微量的DNA進行擴增而造成假陽性
2:血紅素是酶的抑制劑,必須去除干凈,但在去除過程中注意勿丟失DNA。
3:加ddH2O破壞細胞核膜是關系到本實驗結果好壞關鍵的一步,一定使核膜破壞充分,充分使DNA釋放