● 采用第 4 代 TIMS XR cell,具有更寬的動態范圍,進樣 1 微克蛋白,可以在 60 分鐘內鑒定超過 10 萬條肽段(1% FDR);
● 增加的動態范圍與 14 位 Digitizer 可提供出色的定量蛋白質組學結果(CVs值<5%);
● 共同銷售 CellenONE PICO 液體分配系統,推進單細胞蛋白質組學 (SCP) 應用;
● 全新 PaSER?實現實時數據流和智能數據采集控制;
● timsTOF Pro 2 帶動 4D-代謝組學革命,并與領域內的先驅者合作推動小分子生物標志物的發現。
2022 年 6 月 6 日美國明尼蘇達州明尼阿波利斯市 —— 在第 70 屆 ASMS 會議上,布魯克宣布推出新的 timsTOF HT 系統,進一步拓展了革命性的 4D-多組學 timsTOF 平臺。timsTOF HT 采用新型第 4 代 TIMS(trapped ion mobility separation,捕集離子淌度分離)XR cell 和14 位 Digitizer,可實現更寬動態范圍、更深的肽段覆蓋率和更準確的定量分析。該系統在 4D 血漿、組織蛋白質組和表觀蛋白質組學中表現出色。
這些系統性能的提升不以犧牲超高靈敏度和高通量蛋白質組學分析(例如每天分析 50 個樣本(SPD)或是高達 200 SPD 時的超高穩定性為代價,也不影響結果的可靠性(肽段和蛋白水平控制 1% FDR(錯誤發現率)),并且避免了靶向免疫識別方法中固有的抗原交叉反應性。利用 dia-PASEF 技術,timsTOF HT 質譜儀可以從微克級樣本中,在 60 分鐘梯度內鑒定超過 100k 獨特的肽段其定量分析 CV 值更是低于 5%。此外,timsTOF HT 還針對高通量、高深度和無偏血漿蛋白質組學和液體活檢生物標記研究進行了優化。
耶拿大學的 Florian Meier 教授說:“我們與布魯克的合作實現了流程化組織蛋白質組學分析,這是臨床蛋白質組學的一個關鍵領域。由于組織切片和活檢常包含非常異質的細胞群,因此對他們的分析極具挑戰性。timsTOF HT 系統的 dia-PASEF 采集模式可以在寬動態范圍內對蛋白質進行定量分析,即使是在心臟組織等非常困難的樣本中,也不會損失分析通量和靈敏度。”
PrognomiQ 公司蛋白質組學部門副總裁 Bruce Wilcox 博士在胰腺癌研究中使用 Seer Proteograph 和 timsTOF Pro 2,在深度、無偏血漿蛋白質組學中對生物標志物進行探索研究。Wilcox 博士表示:“我們收集了 193 個胰腺癌患者和健康人群的樣本,并采用 5 種 Seer 納米顆粒處理樣本,在這些樣本中共檢測到 3822 種蛋白質。通過使用多個 timsTOF 系統,約 2933 種蛋白質在至少 25% 的患者樣本中被鑒定到。”
在本屆 ASMS 上布魯克還宣布,與 Scienion 達到協議,其具有極高靈敏度的 timsTOF SCP 系統與 CellenONE F1.4 單細胞 pico-分配器和新的 ProteoChip? 進行共同銷售,實現了由單一供應商提供的無偏、非標記單細胞蛋白質組學 (SCP) 解決方案。
Scienion GmbH 首席執行官兼創始人 Holger Eickhoff 博士評論說:“我們很高興與布魯克一起提供完整的 SCP 解決方案。借助擴大合作關系,并通過結合我們 SCP 團隊的專業知識來加速單細胞蛋白質組學解決方案的研究與開發,從而更好地滿足單細胞蛋白質組學界的需求。”
PaSER? 擁有 LFQ 和智能采集模式
在此次 ASMS 上,布魯克展示了 PaSER 實時數據流和反饋循環用于智能采集的過程。PaSER 由布魯克與斯克里普斯的 Jonh Yates 實驗室合作開發,用戶可以完全依賴 PaSER 的實時決策進行采集參數的動態調節功能,對 PTM 選擇性采集、保留時間對齊以及母離子動態納入和排除。這為那些不容易檢測到的候選離子的鑒定和深入分析創造了一個更智能的工具。
荷蘭奈梅亨拉德堡德大學醫學中心轉化代謝實驗室負責人 Alain van Gool 教授說:“在遺傳代謝疾病的個性化診斷中,我們使用質譜法來發現人體內轉化的生物標記物。我們專注于蛋白質標記物的基因表達和糖基化過程,并以此實現疾病診斷。我們使用兩臺 timsTOF 設備開發了創新性的的工作流程,PaSER 所帶來的實時處理,(糖)肽鑒定和儀器參數即時調整功能證明了 timsTOF 速度快并且結果可靠。我們很高興轉化組學中心與布魯克展開合作,為臨床糖蛋白組學研究開發基于智能反饋的采集模式。”
PaSER 2023版可用于 dda-PASEF 實時非標記定量分析 (LFQ),“Run and Done” 的模式保證了大隊列樣本一旦采集完成,就可立即獲得定量結果,PaSER 2023版還整合了 TIMS DIA-NN 1.1 用于 dia-PASEF 數據分析。
高通量和高置信度探索 4D-代謝組學的轉變
高靈敏 timsTOF Pro 2 系統幫助人們探索小分子生物標記物,并以前所未有的規模徹底改變了代謝組學。新工作流程利用了 timsTOF 平臺,在 4D-代謝組學中表現出出色的速度、穩定性和可信度。幫助人們探索生物標記物,以加速藥物發現和新型天然產物研究。
Sapient Bioanalytics LLC 通過使用群體數據來識別超高通量的敏感生物標記物,揭示疾病機制、進程和患者應答相關的途徑,從而加速藥物研發。
照片攝于 Sapient Bioanalytics LLC
Sapient 創始人兼首席執行官、醫學博士/博士 Mo Jain 解釋說:“Sapient 特有的快速 LC-MS 系統可以測量數千種分子,其中也包括血液等樣本中的未表征化合物。我們的下一代 timsTOF Pro 2 系統可以在 43 秒內測量每個生物樣本中超過 11,000 個小分子生物標記物。該系統以其無與倫比的能力,每天可以測量超過 10,000 個生物樣本。”
Enveda Biosciences 首席執行官兼創始人 Viswa Colluru 博士表示,timsTOF Pro 2 系統正在以驚人的速度,不斷發現自然界中的新化合物。他說:“布魯克 timsTOF 提供的捕集離子遷移碰撞截面 (CCS) 數據為自然界中的許多異構體提供了前所未有的 4D 分辨率,使我們能夠在復雜的混合物中找到新的治療化合物。timsTOF Pro 2 將跨時代的無損離子遷移率技術與快速高分辨率 TOF 檢測相結合,幫助我們能在更大自由度范圍內地描繪自然界、更好的在藥物研發上實現工業化應用。布魯克對創新方面和客戶承諾,使他成為一個值得信賴的合作伙伴。我們很高興能繼續與布魯克一起,重新定義代謝組學的界限。”
OligoQuest? 增強型 RNA 和寡核苷酸表征軟件
布魯克的 OligoQuest 軟件提供強大的 RNA 和寡核苷酸表征能力,其中包括反義研究、RNA 治療、CRISPR 引導 RNA 序列的確認以及其他基因編輯技術。布魯克 maXis II 和 timsTOF 平臺帶來了同位素高保真度和質量準確度。借由這兩個平臺,OligoQuest 可通過完整質量和 MS2 分析實現樣品特征確認。(客戶正在使用 OligoQuest 確認異構寡核苷酸中修飾的 RNA 序列和堿基交換。) OligoQuest 不但可以用算法填補了 RNA 和寡核苷酸數據分析的空白,還允許客戶使用他們個性化的寡核苷酸“字母表”,進行標準化或定制化的修改。
布魯克 OligoQuest 軟件
德國庫爾姆巴赫 Axolabs GmbH 運營董事總經理 Ingo R?hl 博士說:“OligoQuest 軟件可以實現異構寡核苷酸分析,進而識別堿基交換。第一個版本的軟件已經滲透在我們的日常工作流程中的方方面面。”
布魯克·道爾頓生物制藥總監 Michael Greig 博士補充說:“Axolabs 是自 2000 年以來首批專注于 RNAi 療法的公司之一。我們要以更有意義的方式解決關鍵問題,并滿足這一類重要客戶的生物制劑需求,因此在 beta 測試階段獲得 OligoQuest 的驗證非常重要。”
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