尿液的涂片內細胞數目明顯增多，包括上皮細胞（移行上皮細胞及鱗狀上皮細胞）和炎癥細胞，且細胞常變性，體積增大，核固縮，胞質內可有液化空泡。
真菌感染時，可見如白色念珠菌的假菌絲和孢子。
病毒感染時，胞核或胞質內可見包涵體。尿結石癥時，可見上皮細胞出現輕度核異質改變，胞質內還可見尿酸鹽結晶。
膀胱粘膜白斑時，可見完全角化的鱗狀上皮，只有通過導尿采取的標本，才可確定為此病。腎移植排斥反應尿細胞學改變指征有七項，兩項恒定指征為淋巴細胞、腎小管上皮細胞，排斥反應至少具備五項指征。
