丙型肝炎病毒（HCV）屬于黃病毒科，基因組為單正鏈RNA，有包膜和核衣殼。主要有5個基因型，我國以Ⅱ型和Ⅲ型為主。丙肝病毒加熱煮沸10分鐘、經1:1000的甲醛在37度下處理96小時及紫外線照射、20%次氯酸和氯仿處理均可滅活病毒。
