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    發布時間:2020-06-22 15:27 原文鏈接: 實時熒光定量PCR具體實驗步驟(二)

    5 制備用于繪制梯度稀釋標準曲線的DNA模板

    ①針對每一需要測量的基因,選擇一確定表達該基因的cDNA模板進行PCR反應。

    反應體系:

    序號  反應物  劑量

    1  10× PCR緩沖液  2.5 ul

    2  MgCl2 溶液  1.5 ul

    3  上游引物F  0.5 ul

    4  下游引物R  0.5 ul

    5  dNTP混合液  3 ul

    6  Taq聚合酶  1 ul

    7  cDNA  1 ul

    8  加水至總體積為  25ul

    輕彈管底將溶液混合,6000rpm短暫離心。

    35個PCR循環(94℃1分鐘;55℃1分鐘;72℃1分鐘); 72?C延伸5分鐘。

    ②PCR產物與 DNA Ladder在2%瓊脂糖凝膠電泳,溴化乙錠染色,檢測PCR產物是否為單一特異性擴增條帶。

    ③將PCR產物進行10倍梯度稀釋: 將PCR產物進行10倍梯度稀釋: 設定PCR產物濃度為1×1010,依次稀釋至109、108、107、106、105、104幾個濃度梯度。

    6 待測樣品的待測基因實時定量PCR

    ①所有cDNA樣品分別配置實時定量 PCR反應體系。

    體系配置如下:

    序號  反應物  劑量

    1  SYBR Green 1 染料   10 ul

    2  上游引物  1ul

    3  下游引物  1ul

    4  dNTP   1ul

    5  Taq聚合酶  2ul

    6  待測樣品cDNA  5ul

    7  ddH2O   30ul

    8  總體積  50 ul

    輕彈管底將溶液混合,6000rpm短暫離心。

    ②將配制好的PCR反應溶液置于Realtime PCR儀上進行PCR擴增反應。反應條件為:93℃2分鐘預變性,然后按93℃ 1分鐘,55℃1分鐘,72℃1分鐘,共40做個循環,最后72℃7分鐘延伸。

    7 實時定量PCR使用引物列表

    引物設計軟件:Primer Premier 5.0,并遵循以下原則:引物與模板的序列緊密互補;引物與引物之間避免形成穩定的二聚體或發夾結構;引物不在模板的非目的位點引發DNA 聚合反應(即錯配)。

    8 電泳

    各樣品的目的基因和管家基因分別進行Realtime PCR反應。PCR產物與 DNA Ladder在2%瓊脂糖凝膠電泳,GoldView?染色,檢測PCR產物是否為單一特異性擴增條帶。


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