盡管過去認為血清沉淀抗體陽性即可明確診斷，但血清抗體的存在既不敏感也不特異。診斷依據環境接觸史，有關臨床特點，胸部X線和肺功能測定及纖維支氣管鏡檢查作出。接觸病史可提供線索（如工作時接觸過抗原的人可無癥狀，或癥狀可在再次接觸后48小時重新出現）。接觸致病抗原的病史并不易查出，尤其是“空調肺”（加濕器肺）。對疑難病例由專家進行的環境調查有助于診斷。對于難下結論或沒有環境接觸史的病人，可行肺活檢。
