在急性膽道感染和腸道炎癥患者中，如突然發生膿毒性的寒戰和高熱，并伴有肝臟腫大和肝區疼痛者，應想到有肝膿腫可能。如患者白細胞數明顯增多，X線檢查發現肝臟腫大，或有液平面可見，且右側膈肌活動受限制者，對診斷更有幫助；而B型超聲檢查作為首選的檢查方法，其陽性診斷率可達96%以上。必要時可在B型超聲定位引導下或在肝區壓痛最明顯處，進行肝膿腫穿刺，以確定診斷。
