①經常監視靈敏度是否有損失，尤其是進行復雜基體檢測后；
②如果清洗了進樣系統、炬管和接口錐后，靈敏度依然較低，則可能意味著離子透鏡系統已經變臟；
③重新調節或者重新優化離子透鏡電壓；
④如果重新優化后的透鏡電壓和以前的電壓有顯著的不同(通常比以前設定的電壓要高)，則極有可能是透鏡變臟；
⑤當透鏡電壓變高得令人無法接受時，意味著離子透鏡系統可能需要清洗或者更換——按照儀器操作手冊推薦的程序進行；
⑥由于離子光學系統設計的不同，有的離子透鏡系統需要用水或稀酸浸泡清洗或超聲清洗，有的離子透鏡系統需要用砂紙和拋光粉進行清潔，并用水和有機溶劑沖洗，有的離子透鏡系統則是消耗品，無法維護，過一段時期后需要更換；
⑦清洗完離子光學系統后，要確保其徹底干燥之后再裝回去，否則水和溶劑會被真空系統抽入質譜儀；
⑧重新安裝離子光學系統時通常推薦使用無塵手套，以避免沾污；
⑨更換離子光學系統時別忘了檢查或者更換O形圈或封圈；
⑩根據儀器的具體工作負荷，一般而言，經過3～4個月使用后，離子光學系統性能通常會變差，建議根據需要進行清洗或更換。