多篇論文聚焦試管污染產生病毒

發布時間：2013-09-24 11:30 原文鏈接：多篇論文聚焦試管污染產生病毒

　　今年早期，來自第三軍醫大學，美國國家心臟、肺和血液研究所的研究人員在《美國國家科學院院刊》(PNAS)雜志上發表了題為“Hybrid DNA virus in Chinese patients with seronegative hepatitis discovered by deep sequencing”的文章，發現了一種新病毒，并將其命名為NIH-CQV。

　　這種病毒來自患有血清陰性肝炎(seronegative hepatitis)的中國患者血清樣品中，研究人員稱NIH-CQV與帶有“患者顯著遺傳異質性”的細小病毒和圓環病毒有關，但是還并不清楚這種病毒與患者疾病病因有何關聯。

　　隨著研究的推進，上周(9月11日)另外一組研究人員又公布了相關的最新研究成果：他們在一項類似的血清陰性肝炎研究的大量臨床樣品中發現了相同的病毒。這些樣品的DNA和氨基酸序列幾乎相同，也與NIH-CQV病毒的序列一致。由于這種病毒出現在所有混合樣品中，因此研究人員懷疑這是由于污染導致的。這一研究成果公布在Journal of Virology雜志上。

　　之后研究人員又對獨立樣品進行了復檢，這次采用了一種不同的技術來提取核酸，結果研究人員在樣品中不再發現該種病毒了。由此他們認為可能是用于實驗的Qiagen公司離心柱出現了污染。

　　為了找到這種病毒的來源，研究人員又將這種病毒與各種數據庫中的病毒序列進行了比對，發現其與美國加州，以及俄勒岡州的海岸附近的樣品宏基因組存在相似性。

　　作者在研究報告中寫道，“由于這些數據的樣品處理和生成過程并未涉及Qiagen公司的離心柱或試劑盒……因此這些研究結果表明，(污染)可能是來自于海水的一種環境病毒，在制造過程無意中污染了離心柱”。

　　目前Qiagen公司的的發言人Thomas Theuringer表示，公司正在檢測這些產品，并嘗試重復這一研究的結果。他指出，對于大多數實驗應用來說，這種潛在的污染應該不會影響到結果。

　　“但是對于‘深度測序’，就像是這項研究中的測序工作，QIAamp UCP產品線也許比較合適，因為這比較于目前的標準方法，具有高出32倍的純度水平”。客戶可以更換其它產品。 “QIAGEN將會為所有購買了QIAamp Viral RNA Mini Kit，或QIAamp UltraSens Virus Kit，進行深度測序研究的客戶進行免費更換，”Theuringer說。

　　來自哥倫比亞大學的病毒學家Vincent Racaniello在其博客上表示，這項研究令人回想起XMRV病毒的研究，這種逆轉錄病毒被認為與慢性疲勞綜合征有關，但最終證明其實是來自于污染源。他表示深度測序是一種重要的研究工具，但是也要倍加小心，“從所用的水，到各種試劑”都要仔細控制。

　　“最重要的是，參與發現病原體的實驗室必須分享他們的序列數據，以防此類情況的發生。”