外顯子組測序發現新的單基因疾病

　　根據《美國人類遺傳學雜志》本周發表的一篇文章，CHAMP1基因上新獲得的突變可能導致一種疾病，具體特征為語言障礙、智力缺陷和一些罕見的面部特征。

　　德國和荷蘭的研究小組對五名兒童開展了外顯子組測序。這五個人沒有親屬關系，但都有著嚴重的語言障礙、智力缺陷，以及罕見但類似的面部特征。將這些兒童的蛋白編碼序列與其父母進行比較，研究人員發現染色體配對相關基因CHAMP1出現了新生的移碼或無義突變。

　　作者認為，對于那些癥狀與已知的遺傳綜合征重疊，比如Prader-Willi綜合征或Angelman綜合征，但相關突變檢測結果為陰性的兒童，可以考慮CHAMP1檢測。“我們認為，對未分類或輕度的畸形，尤其是肌張力減退和嚴重的語言發展遲緩，應當考慮CHAMP1檢測，”他們寫道。

　　許多新生突變都與各種形式的智力缺陷和其他類型的發育遲緩有關聯。在這項研究中，研究人員關注了其中一種形式，它的特點是嘴唇和鼻子異樣，并且說話困難，動作改變。

　　研究人員利用安捷倫的SureSelect XT Human All Exon V5對每位患者及其父母的基因編碼序列進行捕獲，之后利用Illumina的HiSeq 2500或ABI SOLiD 5500XL儀器進行測序。

　　通過分析，他們追蹤到13號染色體CHAMP1基因中的兩個移碼突變和三個無義突變。CHAMP1改變只在患有疾病的兒童中出現，而父母的外顯子組序列中沒有。出人意料的是，研究人員發現兩名不相關的個體有著相同的無義突變。

　　研究人員預測，CHAMP1基因的改變可能影響蛋白產物的鋅指結構域。在細胞分裂過程中，這個蛋白通常位于有絲分裂紡錘體中，介導著絲粒與染色體分離的所需的微管相連。不過，此基因的功能喪失突變卻沒有出現在各大數據庫中，比如dbSNP136或千人基因組計劃的序列數據。

　　作者認為，與染色體配對相關的基因改變往往導致發育遲緩，表明CHAMP1代表了一個有吸引力的候選基因。“我們的數據進一步凸顯了著絲粒和染色體配對在人類神經發育和功能中的重要性。”