吸附色譜中目前最常用的固定相是硅膠，其次是氧化鋁，為了某些樣品的分離，也使用苯乙烯一二乙烯苯等聚合物作為吸附劑。硅膠表面的Si—OH是最主要的吸附點，氧化鋁中Al3+是顯著的吸附中心。選擇吸附劑的原則是樣品的性質和吸附劑本身具有的品質。這些品質包括顆粒形狀、顆粒直徑、表面積、孔徑以及吸附劑表面的酸堿性等。
硅膠吸附劑有兩大類：表面多孔型和全多孔型。全多孔微粒硅膠按形狀又分為球形和非球形，后者又稱為無定形。非球形硅膠制造工藝簡單，價格比較便宜。‘球形硅膠機械強度好，顆粒度均一，是比較好的高效液相色譜填充物。顆粒度一般為5～10μm，常選5μm。
固定相承受樣品量的能力是有限的，它以單位重量的硅膠上能夠負載的樣品量來表示，稱為線性容量。線性容量依賴于固定相的比表面積和表面的均勻程度。微粒硅膠的表面積一般為10～500 m2/g(通常大于200 m2/g)，它們的線性容量為10-3～10-4/g。固定相的孔徑從6到幾十nm，甚至上百nm。選擇孔徑主要根據溶質分子的大小。小分子選用7～12 nm孔徑的，大分子選用30 nm左右，一般來說孔的直徑要比被分析樣品分子的直徑大3倍。
硅膠表面的pH值大約為5，堿性氧化鋁的pH值為12。由于硅膠表面的pH值對大多數樣品沒有催化和強的保留現象，因此常常使用硅膠柱。對于堿性化合物，例如吡啶和胺類選擇硅膠可能不合適，可選用鍵合固定相實現分離與分析，氧化鋁已很少使用。