同源染色體在有絲分裂中的功能與減數分裂中的功能不相同。在每個細胞經歷有絲分裂之前，親體細胞中的染色體會自身復制。但細胞內的同源染色體通常不會配對也不進行基因重組。相反，復制子或姐妹染色單體將沿著中期板排列，然后以與減數分裂II相同的方式分離， 即通過核有絲分裂紡錘體在它們的著絲粒處被拉開。即使在有絲分裂期間姐妹染色單體之間確實發生了交叉，也不會產生任何新的重組基因型 。
