(1)機械法分離:缺點:產量極低;應用的材料受限制;操作極費力
(2)酶法分離:Cocking最早開展這方面研究,克服了機械法分離的缺陷,可分為直接法和順序法兩種。酶法可在短時間內獲得大量原生質體,缺點是:不純的酶制劑所含雜質對原生質體可能有不同程度的毒害作用。