臨床表現主要根據腫瘤的部位和心臟內梗阻的情況不同。
早期患者均常出現發熱，厭食，全身不適，體重減輕等惡性病癥的癥狀，當腫瘤發展到一定程度時，則可相繼引發心臟雜音，胸痛，胸腔積液，呼吸困難及全身各臟器的栓塞，其中以心肺栓塞和腦栓塞最多見。
當腫瘤影響心輸出量時，則出現相應的癥狀如氣短，胸痛，充血性心力衰竭，典型的表現為進行性的不能解釋的充血性心力衰竭，尤其是右心衰，心包積液，暈厥，心律失常，腔靜脈阻塞癥和猝死等，常伴有心包積液和胸腔積液，由于發生于右心房橫紋肌肉瘤較多見，其癥狀和體征常易與右房黏液瘤混淆，主要臨床表現為右心衰竭，系外周血回流受阻所致腔靜脈受壓，阻塞，可出現上，下肢水腫及肝脾腫大，由于肉瘤生長迅速并向心肌浸潤，阻塞心臟血流或遠處轉移而引起死亡，從出現癥狀到死亡為數周至2年，部分病例的心臟肉瘤有遠處轉移，常見轉移的部位為肺，胸部淋巴結，縱隔和直腸，其次是肝臟，腎，腎上腺，骨骼等。