實驗概要
提取樣品組織中的RNA并消除DNA污染
實驗原理
Trizol裂解細胞使RNA釋放
beta巰基乙醇一直RNase活性
酚-氯仿抽提分離RNA
RNase-Free DNase消除DNA污染
主要試劑
Trizol
無水乙醇
氯仿(三氯甲烷)
異丙醇
RQ1 RNase-Free DNase(Promega,M6101)
液氮
RNase-Free water
醋酸鈉緩沖溶液(3M,pH5.2)
主要設備
離心機
研缽
熱塊
離心機
實驗材料
組織樣品
實驗步驟
組織中total RNA的提取
取適量組織(約30mg)于研缽中加入液氮研磨,研碎后轉移至EP管中;
向樣品中加入1mL Trizol,吹勻,放置5min;
向上述EP管中加入200μL氯仿,劇烈震蕩15s,室溫放置3min,4℃12000rpm離心15min;
取上層水相500μL于新的EP管中(注意不要吸入沉淀),加入100μL氯仿,劇烈震蕩15s,室溫放置3min,4℃12000rpm離心15min;
取上層水相400μL于新的EP管中(注意不要吸入沉淀),加入400μL異丙醇,室溫放置10min,4℃12000rpm離心10min;
棄上清,加入1mL 75%乙醇洗滌,輕彈混勻,4℃7500rpm離心5min;
20μL RNase-Free Water溶解RNA;
紫外測定RNA濃度,記錄A260/280,,瓊脂糖電泳鑒定RNA質量。
Total RNA中DNA的
DNA消化體系(100μL)
RNA樣品:10mg(量不足可適量減少)
RQ1 DNase 10* Reaction Buffer:10μL
補水至100μL
如體系加好樣品,37℃孵育30min;
向體系中加入100μl DEPC水;
加入100μl氯仿,震蕩混勻,室溫放置10min;
4℃13200rpm離心15min,吸取上層清夜150μl轉移至新的EP管中;
加入0.1倍體積(15μl)NaAc Buffer及等體積(150μl)異丙醇,室溫沉降30min;
4℃13200rpm離心15min,棄上清,75%乙醇洗滌沉淀;
4℃12000rpm離心5min,棄上清,開蓋放置晾干乙醇;
20μl RNase-Free水溶解RNA;
紫外測量濃度及A260/280,1.5%瓊脂糖電泳檢測RNA狀態。
注意事項
所用工具均經高溫滅菌
EP管、槍頭經DEPC處理
實驗地點盡量選擇空氣流動較少,實驗時帶口罩等。
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