肝阿米巴膿腫多數位于肝頂部,侵襲或穿破膈肌在右肺下葉或中葉形成肺膿腫,有的也類似肝頂包蟲囊腫破入膈肌后形成肝-支氣管瘺,而使肝膿腫排空自愈;或形成阿米巴膿腫;未穿破膈肌的也可有胸腔積液,極少數通過血液途徑發生肺膿腫,肝左葉阿米巴膿腫也可并發左胸或心包阿米巴病。