內核膜
內核膜包圍核質，并被核層覆蓋，能通過核孔復合體與外核膜相連。核層是由中間絲網組成的，能起到穩定核膜的作用，參與染色質功能和整個基因表達的過程。雖然內外核膜和內質網相連，但膜中嵌入的蛋白質傾向于保持在原有的區域上，而不是分散在整個連續體中，提示膜上可能還是有不連續的分界線。
內核膜蛋白的突變可引起幾種核包膜病，包括核纖層蛋白病等，部分癌癥可能也和該位點病變相關。
核孔
核膜上有成千上萬個核孔，每個大的核孔復合體都有約100nm左右長，而在內核膜上的孔道大約有40nm寬，核孔能連接內外核膜。