1.神經影像學檢查(Radiological manifestations)
常用的神經影像學檢查包括電子計算機斷層掃描（Computed Tomography CT）和磁共振成像（Magnetic Resonance Imaging MRI），PET-CT。MRI檢查對于顯示小的松果體區、鞍區腫瘤病灶（小于1cm），脊髓或腦室內等其他部位的小病灶是CT所無法比擬的。對生殖細胞腫瘤的顱內、脊髓轉移灶更有獨到之處，對腫瘤的分期、手術入路的選擇及對放療范圍的確定等都有重要的價值。但CT對有鈣化的顱內生殖細胞腫瘤的觀察明顯優于MRI。
顱內生殖細胞腫瘤在神經影像學上很有特點，但做出診斷前一定和臨床表現及腫瘤標記物的測定相結合才能使診斷更為準確。對可疑病例加強隨診觀察。
2.其它影像學檢查
部分惡性顱內生殖細胞腫瘤可通過血源性向顱外播散，常見肺和骨。而顱內生殖細胞腫瘤的主要發病人群為兒童及青少年，過多的X線檢查可能影響生長發育。是否在治療前常規行胸部X線/CT，全身骨掃描，PET等需要醫生根據具體病例和家屬的要求決定
專家建議，疑顱內生殖細胞腫瘤者應盡可能行全腦全脊髓MRI掃描，既有益于診斷又為更好地治療提供依據。