芋螺毒素的命名規則如下：1個希臘字母表明藥理學活性，1個或2個字母代表芋螺種屬，1個羅馬數字表示二硫鍵框架編號，1個大寫字母表示其變異體。如σ-GⅧA中，σ指出藥理學活性，G代表地紋芋螺（C.geographus），Ⅷ為二硫鍵骨架，而A為該類肽的第一個毒素。若只有克隆基因獲得的成熟肽序列，就用1個或2個字母代表芋螺種屬，1個阿拉伯數字表明半胱氨酸框架，1個阿拉伯數字代表變異體，如Tx5.1、Tx5.2。
