腭扁桃體為一對扁卵圓形的淋巴上皮器官，是由淋巴組織與上皮緊密連在一起所構成的特殊的防御器官。由于其對內、外環境的影響非常敏銳，因此，腭扁桃體的結構隨年齡大小和環境的變化而有所不同，如在幼年時期，腭扁桃體明顯突入咽部，而在青春期以后扁桃體大大縮小，很少突出，但其大小常因人而異。
又稱“扁桃體”。位于舌腭弓與咽腭弓之間。其內面被覆黏膜，有10~20個深陷的小窩，稱扁桃體小窩。外側面對咽壁。外、前、后面均包以結締組織，形成的纖維囊稱為“扁桃體囊”。扁桃體的后外側1~2cm處有頸內動、靜脈通過。它是一對扁卵圓形淋巴上皮器官，長約2.0~2.5cm、寬1.5cm、厚1.0cm。6歲以前發育快，青春期后開始萎縮，到老年則僅留少量淋巴組織。
系一對淋巴上皮性組織團塊。形如核桃，位于兩側扁桃體竇內（但未充滿此竇，其上方有空隙，稱扁桃體上窩）。扁桃體內面對向口腔，覆有粘膜；外面對向咽壁，外面、前面、后面均包有結締組織囊。此囊與其外方的咽肌間，借疏松結締組織連接，故扁桃體發炎化膿時，此疏松組織可形成膿腫。扁桃體在生后6~12個月開始發育，至4~10歲最為發達，14~15歲以后其形體又逐漸縮小。此扁桃體易發生炎癥，亦可致扁桃體肥大與化膿；有些需手術切除。