腎乳頭壞死需與慢性梗阻性腎病、結核髓質海綿腎和其他引起髓質鈣化的疾病作鑒別;表現為長期多尿和夜尿的病例應與其他慢性小管間質性腎病(包括腎髓質囊性病)、腎小管酸中毒、尿崩癥等進行鑒別。如髓質囊腫病其表現是對稱性受累,常合并腎功能顯著下降。反流性腎病放射線學明確證實輸尿管受累且在兒童期有反流的病史腎臟腫瘤,其發生在單側而腎乳頭壞死往往是雙側性病變腎結核可通過抗酸桿菌培養區別這兩類疾病。