1.腸道表現
大部分患者有腹痛、腹瀉、血便或便秘的表現，經結腸鏡及病理組織檢查確診為潰瘍性結腸炎或克羅恩病。
2.脊柱病變
10%～20%的炎性腸病患者有脊柱關節病變，可有癥狀或無癥狀，脊柱病變可發生在炎性腸病之前或之后，有研究顯示以腸道癥狀為首發癥狀者占約70%，少部分的患者是以腰背痛或下肢膝、踝關節炎起病，另有約10%的患者是腸道和關節同時發病。
3.其他病變
可見杵狀指、色素膜炎、皮膚病變，這些病變在克羅恩病患者中更多發，原因不明。皮膚病變包括結節紅斑、多型性紅斑和罕見的膿皮病性壞疽。
