1. 由于四環素能降低凝血酶原的活性，故本品與抗凝血藥合用時，應降低抗凝血藥的劑量。
2. 由于制酸藥（如碳酸氫鈉、鋁、鈣、鎂）可與四環素類藥物合用形成不溶性絡合物而使四環素類藥物的吸收減少、活性降低，故鹽酸米諾環素與制酸藥應避免同時服用。含鐵的制劑可削弱鹽酸米諾環素的吸收。
3. 降血脂藥物考來烯胺（cholestyramine）或考來替泊（colestipol）與本品合用時，可能影響本品的吸收。
4. 由于巴比妥類、苯妥英或卡馬西平可誘導微粒體酶的活性致使本品血藥濃度降低，故合用時須調整本品的劑量。
5. 全麻藥甲氧氟烷和米諾環素合用可導致致命性的腎毒性。
6. 由于抑菌藥物能干擾青霉素的抑菌活性，所以應避免四環素類藥物與青霉素類合用。
7. 米諾環素與強利尿藥（如呋塞米等）合用可加重腎損害。
8. 米諾環素與其他肝毒性藥物（如抗腫瘤化療藥物）合用可加重肝損害。
9. 四環素類藥物和口服避孕藥合用，能降低口服避孕藥的效果。
10. 避免在服用米諾環素前即刻、使用期間及使用后即刻使用異維甲酸或其他系統性類視黃醇或維生素A。這些藥物中的任何一種都與腦假瘤發生有關。
11. 當麥角生物堿或其衍生物與四環素類同時給藥時，會增加麥角中毒的風險。
12. 食物、牛奶和其他乳制品可損害標準米諾環素口服制劑的吸收。然而，食物和牛奶不會顯著削弱微丸膠囊的吸收。