多數的念珠病可能是內源性引起的。促使該病發生的因素很多，最主要的有下列幾種情況：如糖尿病，肺結核，腫瘤，嚴重燒傷，臟器移植等患者均能使機體抵抗力降低而容易發生念珠菌感染；長期大量應用廣譜抗生素可出現菌替代現象或菌替代癥，即使用抗生素后可能引起體內對抗生素敏感的菌群受到抑殺，而某些菌群象念珠菌對抗生素不敏感，則有耐藥性的菌株反日益增殖，從而破壞了體內細菌群間拮抗平衡；長時間使用皮質類固醇激素和免疫掏劑也可招致機體免疫功能下降而有利于念珠菌的感染。
除上述以外，外源性感染也不可忽視，即念珠菌病可由接觸外界菌體而受染。如男性念珠菌性龜頭包皮炎，往往是從其妻有念珠菌性陰道炎傳染所致的；哺乳期婦女的乳頭皮膚念珠菌病，多數來自患有鵝口瘡，也常由其母親患念珠菌性陰道炎所引起的；雙手經常浸水的職業，如再接觸念珠患，亦容易引起本病。
隨著現代醫學進步，各種臟器移植術，心臟外科以及各種導管技術開展，本病發病率有日益增多的趨勢，故值得今后引起注意。