真菌可產生約150種不同毒素，有不少毒素可灰指甲的治療偏方致癌且毒性極強，如霉菌中黃曲霉素B1的毒性比巨毒品氰化鉀還毒幾十倍，是強致癌物灰指甲影響人整體美觀，危害健康，損害自身形象，真菌性甲型灰指甲給工作生活帶來不便，如握手、端茶、傳遞物品、走親訪友等，他（她）人都不愿與之接觸，真菌感染型灰指甲導致手、腳指（趾）頭畸形比較常見，導致截肢也有報道。
