真核基因組：由真核基因編碼的以及感染真核生物的DNA和RNA病毒編碼的基因組。
真核生物的基因組一般比較龐大，例如人的單倍體基因組由3×106 bp堿基組成，按1000個堿基編碼一種蛋白質計，理論上可有300萬個基因。但實際上，人細胞中所含基因總數大概會超過10萬個。這就說明在人細胞基因組中有許多DNA序列并不轉錄成mRNA用于指導蛋白質的合成。DNA的復性動力學研究發現這些非編碼區往往都是一些大量的重復序列，這些重復序列或集中成簇，或分散在基因之間。在基因內部也有許多能轉錄但不翻譯的間隔序列（內含子）。因此，在人細胞的整個基因組當中只有很少一部分（約占2-3%）的DNA序列用以編碼蛋白質。