遺傳毒性 氟西汀及其代謝產物去甲氟西汀的Ames試驗、大鼠肝細胞DNA修復試驗、小鼠淋巴瘤試驗、中國倉鼠骨髓細胞姊妹染色體交換試驗結果均為陰性。
生殖毒性 大鼠在氟西汀劑量為7.5、12.5mg/kg/天（按mg/m2 推算，分別相當于人最大推薦劑量80mg[MRHD]的0.9倍和1.5倍）時未見對生育力的不良影響。
在胚胎-胎仔發育毒性試驗中，大鼠和家兔劑量分別達1 2.5和15mg/kg/天(按mg/m2 推算，分別相當于MRHD的1.5倍和3.6倍)時，未見致畸性。
在圍產期毒性試驗中，大鼠在妊娠期間給予12mg/kg/天（按mg/m2推算，相當于MRHD的1.5倍）或妊娠期間與哺乳期間給予7.5mg/kg/天（按mg/m2 推算，相當于MRHD的0.9倍）時，可見死胎數增加，出生后前7天幼仔重量降低、幼仔死亡率增加。大鼠在妊娠期間給予12mg/kg/天時，存活幼仔未見神經發育毒性。幼仔死亡的無影響劑量為5mg/kg/天（按mg/m2 推算，相當于MRHD的0.6倍）。
致癌性 大鼠與小鼠致癌性試驗中，摻食法給予氟西汀分別達10和12mg/kg/天(按mg/m2 推算，分別相當于MRHD的1.2和0.7倍)，連續給藥2年，未見腫瘤發生率增加。