無芽非金屬厭氧菌為人體正常菌群，屬于條件致病菌，其感染為內源性感染，故缺乏特異有效的預防方法。外科清創引流是預防厭氧菌感染的一個重要措施。
大多數無芽胞厭氧菌對青霉素、氯霉素、氯林可霉素、頭孢菌素敏感，均可用于治療，而對氨基糖甙類抗生素不敏感，對四環素亦大多耐藥。脆弱類桿菌能產生β-內酰胺酶，破壞青霉素和頭孢菌素，故對此類藥物耐藥，在治療時須注意。應選氯霉素和氯林可霉素。此外，滅滴靈對厭氧感染也有很好的療效。由于厭氧菌常與其他需氧或兼性菌混合感染，在選用藥物時應有全面考慮，二者兼顧。
