急性細菌性腦膜炎的預后與病原菌、機體狀況和及早有效的抗生素治療相關,及早開始的抗生素治療與支持性治療使急性細菌性腦膜炎的死亡率降低到10%以下。不過,若治療延遲,或發生在老年人或新生兒中,則腦膜炎往往致命。周圍血象中白細胞計數的降低是預后不良的標志。幸存者偶爾可遺留智力減低、癲癇、腦積水等后遺癥。