對于小膠質細胞來源的觀點包括：
①神經外胚層（與少突神經膠質細胞和星形膠質細胞起源相似）；
②血管外膜；
③中樞神經系統內固有的造血干細胞；
④外周中胚層/間葉組織；
⑤循環血中的單核細胞。小膠質細胞起源于骨髓的單核細胞和（或）骨髓的造血干細胞的說法為大多數學者所接受。
