一、B超顯像檢查 目前B超顯像是輔助診斷內異癥的有效方法。主要用以觀察卵巢內膜異位囊腫，其聲像圖的特征為：
1）最常見的圖像是囊性腫塊，邊界欠清，內有稀疏光點，囊液稠厚、有時因陳舊性血塊濃縮機化而出現密集、粗光點圖像，是混合性腫塊。 [1]
2）腫塊常位于子宮后側，可見囊腫子宮伴隨癥即囊腫圖像和子宮圖像有不同程度的重疊。
3）囊腫有時自發破裂，聲象圖見后陷凹有積液，囊腫較前縮小。
二、腹腔鏡檢查 腹腔鏡檢查是目前診斷內異癥的主要方法。
腹腔鏡可以直接窺視盆腔，見到異位灶可明確診斷，且可根據檢查所見進行分期，便于決定治療方案。腹腔鏡下見到異位灶有很多表現：
1）病灶的顏色可呈紅色、青色、黑色、棕色、白色、灰色等。
2）病灶的形狀可表現為點狀、結節狀、小泡樣、息肉樣等。有時還見到腹膜缺陷或形成小袋狀，其底部有異位灶。
3）病理所見：內膜腺體及間質。
三、免疫學檢測 近年來很多研究認為內異癥的發病與免疫有關，在細胞免疫缺陷的婦女，內膜碎片可種植于腹膜以致發生內異癥。目前已有數種免疫指標，可以作為診斷內異癥的參考：
1）巨噬細胞;
2）白介素I及Ⅱ;
3）自身抗體;
4）細胞免疫、體液免疫及補體。
女性不孕檢查方法
1、子宮輸卵管造影術：生殖道無炎癥的女性在月經干凈的3—7天，在B超下將造影劑注入子宮，觀察造影劑充盈子宮和輸卵管的情況。
2、宮腔鏡檢查：應用宮腔鏡檢查，了解宮腔內情況，可發現宮腔粘連、黏膜下肌瘤、息肉、子宮畸形等可能導致不孕的病變。檢查時也可在宮腔鏡直觀下進行治療。
3、腹腔鏡檢查：需進一步了解盆腔情況，可采用腹腔鏡檢查。腹腔鏡檢查能直接觀察子宮、輸卵管、卵巢有無病變或粘連，確定輸卵管是否暢通;約有20%的病人通過腹腔鏡可以發現術前沒有診斷出來的病變。
4、免疫學檢查：這種方法可以了解是否存在抗精子抗體，除進行抗精子抗體檢測外，還可進行性交后試驗、體外精子穿透試驗等對其進行了解。
5、內分泌功能測定：例如在月經周期的不同時間做血清雌激素、孕激素水平的測定，以了解卵巢功能的情況;測定基礎代謝率，以了解甲狀腺功能;進行腎上腺功能檢查以及血清泌乳素測定等。