卵巢早衰癥的病因在絕大多數患者中尚不清楚.認為與遺傳、自身免疫過程、感染等有關。其中有關卵巢早衰與自身免疫的研究最多，已發現的異常包括FSH的抗體、FSH受體的抗體、甲狀旁腺、甲狀腺和腎上腺的抗體等，一些患者經免疫抑制治療后有卵巢功能的恢復。
自身免疫性疾病的檢測包括血鈣、磷、空腹血糖、清晨皮質醇、游離T4、TSH、甲狀腺抗體（如甲狀腺功能異常）、全血計數、血沉、總蛋白、白蛋白/球蛋白比例、風濕因子、抗核抗體等。
遺傳方面的異常亦是異質性的和多因素的，包括FSH受體異常、X和Y染色體同源序列的易位、FSH結構異常（不能與受體結合）等。感染因素包括腮腺炎、病毒感染等。
正常婦女卵巢功能45～50歲時才開始衰退，如果在40歲以前出現衰退跡象，醫學上稱之為卵巢功能早衰。這種女性常伴有閉經或少經、促性腺激素水平的上升和雌激素水平的下降，臨床表現為不同程度的潮熱多汗、陰道干澀、性欲下降等絕經前后癥狀。
卵巢早衰，是指已建立規律月經的婦女，40歲以前，由于卵巢功能衰退而出現持續性閉經和性 器官萎縮，常有促性腺激素水平的上升和雌激素的下降，臨床表現伴見不同程度的潮熱多汗、陰道干澀、性欲下降等絕經前后癥狀，使患者未老先衰，給其身心健康和夫妻生活帶來極大痛苦。卵巢早衰，影響女性生活質量。