克雷白桿菌屬肺炎的發病率國內外統計的比例有一定差異，國內主要是數家大醫院及局部地方的調查，且集中于院內獲得性肺炎。據北京協和醫院1983～1992年的統計，克雷白桿菌屬肺炎的發病率為40.9%，居NP的第2位。世界范圍的統計，克雷白桿菌屬肺炎占全部肺炎1%～8%，美國20世紀80年代初的發病率為7.4%，其中在院內獲得性肺炎中所占比例，80年代前期12.8%，中、后期為11.6%（NNIS報告）。僅次于銅綠假單胞菌及金黃色葡萄球菌肺炎，居NP的第3位。社會獲得性肺炎（community-acquired pneumonia，CAP）的實際調查受到諸多因素的限制，缺乏統一的報告。克雷白桿菌屬肺炎占CAP中革蘭陰性桿菌肺炎發病率的16%～64%，現認為肺炎克雷白桿菌是CAP常見的病原菌之一。進入90年代，國外統計克雷白桿菌屬肺炎的發生率為7%，雖略有降低，排序也降至第4位，但實際發病人數與80年代基本持平，且耐藥株所致的所謂“超級感染”（superinfection）數量大大增加了。
近年來，通過對NP的調查發現，肺炎克雷白桿菌與其他細菌、真菌混合感染逐漸增多，據1989年一項統計發現，在95例白色念珠菌呼吸道感染病人中，合并肺炎克雷白桿菌感染者達38.9%左右。此外，各項研究發現，克雷白桿菌屬肺炎病人菌血癥的發生率在25%左右，臨床常可通過血培養來確定病原菌。
在抗生素應用之前，克雷白桿菌屬肺炎的病死率高達51%～97%，隨著各種抗生素的應用及預防措施的采取，病死率大大降低。但相比其他部分肺炎，病死率仍偏高，據美國NNIS統計，60～80年代后期，院內獲得性克雷白桿菌肺炎的病死率為18%～30%；國內北京協和醫院統計，院內克雷白桿菌屬肺炎的病死率達50%。