PK缺乏癥應與其他紅細胞酶病如G-6-PD缺乏癥及血紅蛋白病相鑒別。白血病、再生障礙性貧血 骨髓增生異常綜合征 化療后都可以引起繼發性PK缺乏,因此遺傳性PK缺乏癥(通常是雜合子)應與繼發性PK缺乏癥相鑒別 但有時此二者的鑒別相當困難 因為二者紅細胞PK活性都是輕至中度降低,一般都沒有明顯的溶血表現,有時需要進行隨診和仔細分析。