來源于腫瘤細胞的ccfDNA又稱為循環腫瘤DNA(Circulating cell-free
DNA,ctDNA)。ctDNA含量與腫瘤進展階段密切相關,準確檢測ctDNA含量對腫瘤診斷和治療有十分重要的意義。然而相較于全部ccfDNA,血液里ctDNA的含量很少,表現為非常低的等位基因頻率。因此,通過PCR和三代測序的方法檢測超低濃度的ctDNA時,產生誤差的概率大大增加。全世界的科研工作者就如何降低這類誤差做出了許多探索。近日,美國科學家借助LightBench全自動核酸凝膠電泳成像分析回收系統,并將獨特應用發表了文獻《Automated
size selection for short cell-free DNA fragments enriches for
circulating tumor DNA and improves error correction during next
generation
sequencing》。研究指出,通過提取較短片段的ccfDNA可以提高ctDNA的基因頻率,從而實現ctDNA的富集并且減少PCR和測序結果的誤差。