③基質的活化與抗體的偶聯:活化與偶聯反應條件要求溫和、簡單,盡可能降低對抗體的活性和基質結構的破壞。基質活化通常在骨架上引入強親電基團,然后與抗體上的親核基團如—NH2、—OH、—SH 等發生取代反應,使抗體連接于基質上(偶聯)。雖然抗體的化學特性直至20世紀中葉才被揭示,利用抗體進行分析卻已有百年的歷史。抗血清中的抗體含量最多的是 IgG,所以常用其制備免疫吸附劑。已有人研究多樣性的抗原結合片段對增加識別位點濃度的各種優點,但實驗室還沒有廣泛的應用,如 Fab 片段很容易從單抗或多抗中獲得,這種片段已被用作在線偶聯毛細管電泳的免疫吸附劑。IAC 技術應用的抗體有兩種類型,即單克隆抗體(McAbs)和多克隆抗體(PcAbs)。與單抗相比,多抗的抗原決定基的特異性和結合特性是多樣的,因此制備時使用純抗原,以防止產生不必要的抗體。但是多抗包含了所有的抗體亞類,對變性條件的抵抗力也高于單抗,因此多抗制備的IAC 柱壽命較長。抗體偶聯分為隨機偶聯和定向偶聯兩種,隨機偶聯的抗體以其不同部位隨機偶聯到同相載體上,將導致抗體與抗原結合的活性位點變少,損失結合力,完全隨機偶聯會損失66%的結合力。定向偶聯的抗體偶聯到基質后抗原結合位點指向流動相,抗體偶聯部位應為 Fc 片段、末端蛋白或通過連接分子偶聯。可以應用來自葡萄球菌細胞壁的PrA 與 PrG 結合抗體分子的 Fc 部位,也可用胃蛋白酶水解抗體,產生 Fab 或單鏈抗體(Fv),其 C 端巰基定向固定于基質。