1. 先天性跖骨內收：外觀上于先天性馬蹄足相類似，容易誤診，其有足前部內收及姿勢性足內翻，但無馬蹄畸形，在進行X光片檢查時可以發現其正側位片跟距角均正常，在背伸情況下患兒踝關節可以背伸到正常兒童程度(30度以上)。
2. 先天性垂直距骨：此類患兒為距舟關系異常導致的足部畸形，其外觀與先天性馬蹄足有較明顯不同，但仍引起足夠的重視，患兒足底部可以觸及1枚明顯凸起的骨頭，為脫位的距骨頭，踝關節活動范圍縮小。X光片在極度跖屈情況下距舟關節呈脫位狀態。
3. 扁平足畸形：患兒可有足部扁平，在嬰幼兒期不明顯。但年齡較大的患兒可有足部疼痛等不適，X光片提示：跟距角度正常，足弓消失。無需特殊治療。
4. 多關節攣縮：先天性多關節攣縮癥是指嬰兒出生時即有2個或更多的關節先天性攣縮，其足部可表現為雙側馬蹄內翻畸形。在嬰幼兒階段早期進行手法治療，大多數患兒治療效果滿意。患兒生后最初的4個月中的治療是至關重要的，手法治療能改善關節活動度、保持和加強肌肉生長、減少手術。
5. 神經源性：各種神經原因引起的馬蹄內翻畸形，包括：脊髓脊膜膨出、脊髓栓系、遺傳性神經系統脫髓鞘疾病、腦癱后遺癥等，此類患兒治療足部畸形較為僵硬且容易復發，治療也應及早進行，但術后需要佩戴支具維持。[1]