將一對能可逆結合和解離生物分子的一方作為配基（也稱為配體），與具有大孔徑、親水性的固相載體相偶聯、制成專一的親和吸附劑，再用此親和吸附劑填充色譜柱，當含有被分離物質的混合物隨著流動相流經色譜柱時，親和吸附劑上的配基就有選擇地吸附能與其結合的物質，而其他的蛋白質及雜質不被吸附，從色譜柱中流出，使用適當的緩沖液使被分離物質與配基解吸附，即可獲得純化的目的產物。
