亞基(subunit)是生物學術語,指有些蛋白質分子含有兩條或多條多肽鏈,每一條多肽鏈都有完整的三級結構。
亞基與亞基之間呈特定的三維空間排布,并以非共價鍵連接,它是具有四級結構的蛋白質中最小的共價單位。亞基之間的結合力主要是疏水作用,其次是離子鍵、氫鍵和范德華力。