• <option id="immmk"></option>
  • <noscript id="immmk"><kbd id="immmk"></kbd></noscript>
    發布時間:2021-02-23 10:53 原文鏈接: 云序超微量MeRIP測序技術在m6A甲基化文章發表的應用1

    m6A甲基化是近年來一大熱門研究方向,種種研究表明m6A修飾在各種真核生物、各類組織細胞中普遍存在,并對多種生物學功能、疾病腫瘤的發生發展具有極大影響。m6A甲基化位點的檢測依賴于MeRIP-seq,其中的抗體免疫共沉淀(IP)環節要求樣品RNA起始量相較普通轉錄組測序要高,曾經令許多難以大量獲取的組織、細胞或體液樣本被拒在m6A研究的大門之外。

    云序生物自2018年推出了超微量RNA甲基化測序(超微量MeRIP-seq),對免疫共沉淀和高通量測序步驟進行優化,克服了常規抗體富集至少需要100μg總RNA的難題,實現了僅需500ng總RNA即可IP、建庫測序,為微量樣本研究m6A等甲基化修飾帶來福音。本期我們就為大家解析兩篇云序客戶近期發表的應用了超微量merip技術測序的m6A表達譜文章。

    文章1:高度近視眼晶狀體前囊膜的m6A修飾譜


    發表日期:2020.10.27

    研究單位:天津醫科大學眼科醫院孫靖教授團隊

    影響因子:4.251

    研究方法m6A-MeRIP-seqRNA-seq

    樣品類型:單純白內障患者和高度近視的白內障患者晶狀體前囊膜

    樣本數量:3 :3

    RNA量:低至500ng

    文章鏈接Comprehensive analysis of transcriptome-wide m6A methylome in the anterior capsule of the lens of high myopia patients
    文章解析:
    1)m6A位點的統計和分布

    文章通過m6A-MeRIP-seq,在單純白內障患者和高度近視的白內障患者晶狀體前囊膜中分別檢測到13617和8569個m6A位點,發生m6A修飾的基因分別為8196和5896個。文章展示了兩組中m6A位點的分布和motif序列,并對具有單個和多個m6A位點的基因進行了統計。


    2)m6A修飾基因的功能

    為了探究m6A修飾與高度近視的關系,文章對兩組間差異基因進行了GO和KEGG分析,發現m6A修飾差異基因多與細胞外基質的結構變化和形成有關。


  • <option id="immmk"></option>
  • <noscript id="immmk"><kbd id="immmk"></kbd></noscript>
    伊人久久大香线蕉综合影院首页