1.自然轉陰。對于成年后因水平傳播(因接觸乙肝病人血液及體液引起的傳播)而染上乙肝病毒者，由于免疫功能的作用，每年有10%~20%的乙肝e抗原轉陰，但如果是母嬰傳播或嬰幼兒期感染的病人，則乙肝e抗原轉陰率要低得多(3%~5%).
2.急性發作后轉陰。由于機體免疫功能被激活，免疫細胞攻擊于肝細胞內的乙肝病毒，使肝細胞損壞，病毒被抑殺，此時可出現錢過性丙氨酸基轉移酶升高。
3.應用抗病毒藥物治療轉陰。如干擾素使病人的乙肝e抗原轉陰率達30%~40%，拉米夫定使病人的乙肝e抗原轉陰率第1年達20%，第2，3，4年可達30%、40%及50%左右。
4.中藥方法。目前對于乙肝e抗原沒有特效藥，主要是在生活中注意養肝護肝，另外配合使用中藥方法進行治療，選擇苗藥楊氏乙肝方促進肝功能恢復。