由深圳華大基因研究院發起,中國科學院昆明動物研究所、中國科學院動物研究所、成都大熊貓繁育研究基地和中國保護大熊貓研究中心參與的合作研究成果《大熊貓基因組測序和組裝》,1月21日以封面故事形式在國際權威雜志《自然》上發表。
在國家林業局、深圳市政府、深圳市鹽田區政府及相關企業的支持下,“大熊貓基因組”項目于2008年3月啟動。研究表明,大熊貓有21對染色體,基因組大小為2.4G,重復序列含量36%,基因2萬多個。盡管大熊貓種群的數量據估計僅為2500只,測序研究表明大熊貓基因組仍然具備很高的雜合率,從而推斷具有較高的遺傳多態性。
這是全球第一個完全使用新一代合成法測序技術完成的基因組序列圖,全部組裝和分析軟件都是深圳華大基因研究院自主編寫。這一成果證明了短序列也能組裝成完整基因組,并將成為基因組繪圖的國際標準,集中體現了中國的科技競爭力和中國科學家的創新能力。
研究成果填補了大熊貓基因組及分子生物學研究的空白,將從基因組學的層面上為大熊貓這種瀕危物種的保護、疾病的監控及其人工繁殖提供科學依據,并為保護我國其他一級保護動物提供范例。
華大基因同時宣布,啟動“1000種動植物基因組計劃”,計劃未來兩年內為一千種重要動植物進行測序,并從科學界征集測序物種的提案。由國際專家組成的委員會將從各地研究者的提案中挑選測序物種,評選條件包括物種的重要性,申請人的匹配資金狀況,項目的科學水平以及實驗設計等。委員會將根據具體情況建議使用相關的測序方法,并且界定參考基因組的標準。
華大基因科技合作部李卓表示:“該項目將為被測序物種的各種研究提供可靠的基礎,比如同一物種各種品系的基因組學研究、表觀基因組學和轉錄組學研究等。另外,各國科學家們可以利用這些公開數據來培育高產的糧食作物品種和優質的畜牧品種。”
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