該發現可能有助于開發其它標靶Rho的抗生素
與人類相比，細菌不攜帶過多的“垃圾DNA”，它們的基因組要“整潔”得多。比如大腸桿菌大約90%的基因組都包含編碼蛋白質的DNA，而人類基因組的90%都是非編碼的“垃圾DNA”。
美國科學家近日研究發現，細菌基因組的這種“整潔”可能要歸功于一種名為Rho的古老蛋白。它具有調節功能，能夠平衡基因的活性并能結合輔助因子“沉默”外來DNA.。相關論文5月16日發表在《科學》（Science）雜志上。
美國紐約大學醫學院的Evgeny Nudler和同事結合了基因組學和蛋白質組學方法，用常用的動物抗生素——雙環霉素抑制Rho的活性，觀測了基因的開關情況。接下來，研究人員利用微分基因電泳（DIGE）技術挑出了大腸桿菌基因響應抗生素而產生的蛋白，并用質譜學方法鑒別了這些蛋白。
Nudler表示，“我們的研究顯示了Rho是廣泛存在的，它幾乎能夠終止所有基因內的轉錄。它的第一個主要功能就是調節轉錄水平以適應細菌的翻譯需求。”換句話說，Rho確保細菌不會負荷太多的蛋白。Nudler說：“Rho對于細菌的生存是必需的，因為看起來它‘牽制’了潛在的有毒基因。”
論文第一作者、紐約大學醫學院的Christopher J. Cardinale說：“Rho是一種古老的蛋白，細菌中到處都是。”他推測，Rho使細菌能夠快速生長。他說：“細菌如此之小，它們不會攜帶過多的額外DNA。在進化過程中，Rho可能使得基因被緊湊地‘打包’起來，從而反過來促進了細菌的快速生長。”
另外，通過進一步分析，研究人員發現，Rho能夠連同兩個輔助因子一起“沉默”大腸桿菌體內的外來DNA。此外來DNA對大腸桿菌細胞具有毒性，在數百萬年前通過橫向事件（基因交換）進入大腸桿菌體內。
研究人員表示，這一發現目前尚沒有直接的臨床應用。不過他們推測，這一發現可能有助于開發其它標靶Rho的抗生素，因為大多數細菌對抗生素的抗性都是通過橫向轉移獲得的。（科學網 梅進/編譯）
（《科學》（Science），Vol. 320. no. 5878, pp. 935 – 938，Christopher J. Cardinale，Evgeny Nudler）
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